domingo, 24 de agosto de 2014

PROTEÍNAS

PROTEÍNAS

Las proteínas son moléculas complejas imprescindibles para la estructura y función de las células. Su nombre proviene del griego proteos que significa fundamental, lo cual se relaciona con la importante función que cumplen para la vida.


Ilustracion 1. Visión general de las proteínas
Fuente:Department of Molecular Biology and Biotechnology
 
Mientras que los ácidos nucleicos transportan la información genética de la célula, la responsabilidad básica de las proteínas es ejecutar las tareas dirigidas por esa información. las proteínas son las más variadas de las macromoléculas y cada célula contiene miles de proteínas diferentes que realizan una amplia gama de funciones, entre ellas es servir como componentes estructurales de células y tejidos, actuar en el transporte y almacenamiento de pequeñas moléculas, la propiedad fundamental de las proteínas es su capacidad para actuar como enzimas, que catalizan casi todas las reacciones químicas en los sistemas biológicos, de este modo las proteínas dirigen virtualmente todas las actividades de la célula. 

Las proteínas son polímeros de 22 aminoácidos distintos, cada aminoácido consiste en un ácido de carbono ligado a un grupo carboxilo, un grupo amino, un átomo de hidrogeno y una cadena lateral. Las propiedades específicas de las diferentes cadenas laterales de los aminoácidos determinan los papeles de cada aminoácido en la estructura y función proteica. Los aminoácidos pueden agruparse en cuatro categorías, dependiendo de las propiedades de las cadenas laterales y son: los aminoácidos no polares, aminoácidos polares, aminoácidos básicos, aminoácidos ácidos



Ilustracion 2. Aminoácidos, se indican las abreviaturas 
de tres y una letra para cada aminoácido 


Los aminoácidos están unidos por enlaces peptídicos y estos polípetidos son cadenas lineales de aminoácidos. La característica definitoria de las proteínas es que son poli-péptidos con secuencias de aminoácidos específicos determinada por el orden de nucleótidos por un gen. La secuencia de aminoácidos de una proteína es solo el primer elemento de su estructura, en vez de ser cadenas prolongadas de aminoácidos, las proteínas adoptan configuraciones tridimensionales características que son cruciales para su función. Estas configuraciones de las proteínas son interacciones entre sus aminoácidos constituyentes, así que la forma de la proteína viene determinada por su secuencia de aminoácidos. 
ESTRUCTURA PROTEICA

Ilustración 3. Estructura de las proteínas
Fuente: biologia.edu.ar
 

 
Estructura primaria
Las proteínas tienen múltiples niveles de estructura. La básica es la estructura primaria.
La estructura primaria de una proteína es simplemente el orden de sus aminoácidos.

Por convención el orden de escritura es siempre desde el grupo amino-terminal hasta el carboxilo final.
La estructura primaria de una proteína es simplemente el orden de sus aminoácidos. Por convención el orden de escritura es siempre desde el grupo amino-terminal hasta el carboxilo final.
Para encontrar datos sobre  las estructura de , por ejemplo la hexoquinasa,  navegue hasta
Brookhaven Protein Data Bank 3D browser y entre hexokinase para la búsqueda, o SCOP (Structural Classification of Proteins) y use la referencia PDB número 1HKG.
Como consecuencia del establecimiento de enlaces peptídicos entre los distintos AA que forman la proteína se origina una cadena principal o "esqueleto" a partir del cual emergen las cadenas laterales de los aminoácidos -
Estructura primaria de la Insulina: consta de dos cadenas de AA enlazadas por puentes disulfuro entre las cisteínas
 Ilustración 4. Cuadros de estructuras primarias
Fuente: biologia.edu.ar
 
Estructura secundaria
La estructura secundaria de una proteína es la que adopta espacialmente. Existen ciertas estructuras repetitivas encontradas en las proteínas que permiten clasificarlas en dos tipos: hélice alfa y lámina beta.
Una hélice alfa es una apretada hélice formada por una cadena polipeptídica. La cadena polipetídica principal forma la estructura central, y las cadenas laterales se extienden por fuera de la hélice. El grupo carboxílo (CO) de un aminoácido n se une por puente hidrógeno al grupo amino (NH) de otro aminoácido que está tres residuos mas allá ( n + 4 ). De esta manera cada grupo CO y NH de la estructura central (columna vertebral o "backbone") se encuentra unido por puente hidrógeno.
Existen tres modelos de alfa hélice.
 
Existen tres modelos de alfa hélice. El primero muestra solo al carbono alfa de cada aminoácido. El segundo muestra todos los átomos que forman la columna vertebral del polipéptido .
 

 
                          









      
                 

                      Ilustración 5. Modelos de alfa hélice
                                      Fuente: biologia.edu.ar

El tercero y mas completo modelo, muestra todos los puentes hidrógeno que mantienen la alfa-hélice. Las hélices generalmente están formadas por aminoácidos hidrófobos, en razón que son, generalmente, la máxima atracción posible entre dichos aminoácidos. Las hélices se observan, en variada extensión, prácticamente en todas las proteínas.
 
      Ilustración 6. Puentes hidrógeno que mantienen la alfa-hélice.
 Fuente: biologia.edu.ar
 
     
B-Las láminas beta son el otro tipo de estructura secundaria. Pueden ser paralelas o antiparalelas. Las anti-paralelas generalmente se ven así:

 Ilustraciones 7. Laminas de proteínas
                                                                Fuente: biologia.edu.ar
Y los giros que tienen en su estructura :
 
 
 
Ilustración 8. Giros de la estructura 
Fuente: biologia.edu.ar
 
     
Donde el aminoácido n se une por puente hidrógeno al aminoácido (n +3) .
Existe un tipo especial de modelo molecular para resaltar la estructura secundaria de las proteínas.  Este tipo de modelo de proteína representa los segmentos de lámina-beta como cintas en flecha (ribbons) y las alfa hélices como como cintas en espiral.
Ilustración 9. Prión en su forma PrPsc presenta gran proporción de láminas beta (43% láminas beta, 30% hélices alfa).
  Fuente: biologia.edu.ar
 
El resto de la cadena polipeptídica se referencia como un espiral al azar ("random coil"), y se dibuja como una fina línea. Por favor, note que espiral al azar o "random coil" es un nombre que lleva a confusión, dado que las proteínas están altamente organizadas, pero esta región no tiene una estructura secundaria con componentes difíciles de categorizar.
 
Estructura Terciaria
 
La estructura terciaria es la estructura plegada y completa en tres dimensiones de la cadena polipeptídica, la hexoquinasa que se usa como icono en esta página es una estructura tridimensional completa.

Resultado de imagen para estructura terciaria de las proteinas globulares
 Ilustración 10. Estructura terciaria
 Fuente: biorom.uma.es
 
A diferencia de la estructura secundaria, la estructura terciaria de la mayor parte de las proteínas es específica de cada molécula, además, determina su función.
EL plegamiento terciario no es inmediato, primero se agrupan conjuntos de estructuras  denominadas dominios que luego se articulan para formar la estructura terciaria definitiva. Este plegamiento está facilitado por uniones denominadas puentes disulfuro, -S-S- que se establecen entre los átomos de azufre del aminoácido cisteína.
Existen, sin embargo dos tipos de estructuras terciarias básicas:
  • proteínas fibrosas, insolubles en agua, como la alfa queratina o el colágeno y
  • proteínas globulares, solubles en agua.

Solo está presente si hay mas de una cadena polipeptídica. Con varias cadenas polipeptídicas, la estructura cuaternaria representa su interconexión y organización. Esta es la imagen de la hemoglobina, una proteína con cuatro polipéptidos, dos alfa-globinas y dos beta globinas. En rojo se representa al grupo hem (complejo pegado a la proteína que contiene hierro, y sirve para transportar oxígeno).
Ilustración 11. Estructura cuaternaria
Fuente: biologia.edu.ar
 
 
Este documental te podría servir para comprender más este tema de proteínas:
 
 
Referencias:
Raisman, J.,Gonzales, A.. (2007). Proteínas: de la estructura primaria a la cuaternaria. Hipertextos del àrea de la biología,  Sitio web: http://www.biologia.edu.ar/macromoleculas/structup.htm#inicio

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